A ALPHENZ possui sistemas biológicos e físico químicos, dependendo do efluente e necessidade de cada cliente.
O sistema biológico é composto por reator anaeróbio e/ou reator aeróbio com aeração por soprador de ar e difusores de bolha fina, e decantador secundário. Seu sistema possui como forma opcional a inserção de caixa de gradeamento, separador de areia e óleo, elevatória de esgoto, filtros, sistema de desinfecção por cloro, e sistema de desodorização de maus odores por carvão ativado, ultrafiltração e osmose reversa.
O sistema físico-químicos é composto por floco-decantação, filtros e leitos de manta, ou filtro-prensa, para separação do lodo gerado no processo de limpeza do efluente industrial. O sistema de filtração em areia e carvão e de desinfecção fica ao fim do processo. As dosagens dos reagentes são realizadas por bombas dosadoras acopladas ao sistema, as quais são acionadas por painel de controle de forma automática. Também acompanha o sistema, controlador automático de pH, válvulas automáticas, tanques de preparação de reagentes e agitadores.